Der Spieler steuert einen Tenno aus der Third-Person-Perspektive. Es lassen sich Waffen, Ausrüstung und Warframes (die Rüstung der Tennos) mittels sammelkartenartiger Upgrades, Modifikationen (Mods genannt) verbessern.
Jeder Warframe bietet seinem Träger einzigartige Vorteile und Eigenschaften. Waffen und Warframes können in einem Shop gekauft, oder mittels Blaupausen auch in einer Schmiede selbst gebaut werden, die nötigen Ressourcen vorausgesetzt.
Missionen lassen sich per Sonnensystemkarte auswählen. Es gibt diverse Missionsmodi wie beispielsweise Auslöschung, Verteidigung, Gefangennahme, Rettung, Ausgrabung, Überleben, Spionage, Attentate und Alarmeinsätze.
In den Einsätzen gewinnen die Spielfigur, der Warframe und die eingesetzten Waffen an Erfahrungspunkten. In den Missionen lassen sich Ressourcen, Credits, Munition und nützliche Upgrades einsammeln.